Como director
* Vincent (1982) - cortometraje
* Luau (1982) - cortometraje
* Hansel y Gretel (1982) - mediometraje
* Frankenweenie (1984) - mediometraje
* La gran aventura de Pee-Wee (1985)
* Beetlejuice (Bitelchus) (1988)
* Batman (1989)
* Edward Scissorhands (1990)
* Batman Returns (Batman vuelve, Batman regresa) (1992)
* Ed Wood (1994)
* Mars Attacks! (1996)
* Sleepy Hollow (1999)
* The World of Stainboy (2000) - (miniserie emitida por Internet)
* El Planeta de los Simios (2001)
* Big Fish (2003)
* Charlie y la fábrica de chocolate (2005)
* Corpse Bride (2005)
* Sweeney Todd (2007)
* Alicia en el país de las maravillas (2010)
* Dark Shadows (2011) - Inicio de rodaje: Abril 2011
* Frankenweenie (2012) - Remake en fase de pre-producción (Estreno USA: 9 de Marzo de 2012)
* Bones de The Killers
Como animador
* Stalk of the Celery Monster (1979)
* El Zorro y el Sabueso (Tod y Toby) (1981) - No acreditado
* Luau (1982)
* Tron (1982) - No acreditado
* Taron y el caldero mágico (1985) - No acreditado
Como productor
* Edward Scissorhands (1990)
* Batman Returns (1992)
* The Nightmare Before Christmas (1993)
* Cabin Boy (1994)
* Ed Wood (1994)
* Batman Forever (1995)
* James and the Giant Peach (James y el Melocotón Gigante) (1996)
* Mars Attacks! (1996)
* The World of Stainboy (2000)
* Corpse Bride (2005)
* 9 (2009)
* Alicia en el país de las maravillas (2010)
* Frankenweenie (2012) — Remake en fase de pre-producción - Estreno USA: 9 de Marzo de 2012
Como guionista
* La isla del Dr. Agor (1971)
* Stalk of the century (1979)
* Doctor of Doom (1979)
* Hansel y Gretel (1982) — capítulo de televisión
* Luau (1982)
* Vincent (1982)
* Frankenweenie (1984)
* Edward Scissorhands (1990)
* The Nightmare Before Christmas (1993)
* Lost in Oz (2000)
* The World of Stainboy (2000)
* Frankenweenie (2012) - En fase de preproducción.
En televisión
* Serie Teatro Fantástico - Director de capítulo Aladino y su Lámpara Maravillosa (1985)
* Serie Alfred Hitchcock Presenta - Remake de capítulo "The Jar" basado en el cuento del mismo nombre de Ray Bradbury(1985)
* Serie Historias asombrosas: Perro de familia - animador de personajes (1993)
* Perdidos en Oz - no producido
En cameos y otros trabajos
* La Película de los Muppet (1979) - Como actor manejador de un muppet
* Solteros (1992)
* Hoffa (1992)
* La melancólica muerte del Chico Ostra y otras historias (1997) - Libro de poemas oscuros
* Coraline (2009) - Promoción
